Ecco un esempio di un semplice file content.opf per l'EPUB 2.

		<?xml version='1.0'?>
		<package xmlns='http://www.idpf.org/2007/opf' unique-identifier='bookid' version='2.0'>
		  <metadata xmlns:dc='http://purl.org/dc/elements/1.1/' xmlns:opf='http://www.idpf.org/2007/opf'>
		    <dc:title>Markup Ecomind</dc:title>
		    <dc:identifier id='bookid'>urn:uuid:Documento interno</dc:identifier>
		    <dc:language>it</dc:language>
		    <dc:subject>Guida al markup di ecomind</dc:subject>
		    <dc:description>Lista dei markup del markup di ecomind</dc:description>
		    <dc:relation>http://www.ecomind.it</dc:relation>
		    <dc:creator opf:role='aut'>Marco Roversi</dc:creator>
		    <dc:publisher>Ecomind srl</dc:publisher>
		    <dc:rights>Copyright (c), 2009, Ecomind</dc:rights>
		    <meta name='cover' content='cover-image' />
		  </metadata>
		  <manifest>
		    <item id='ncx' href='toc.ncx' media-type='application/x-dtbncx+xml' />
		    <item id='css' href='css.css' media-type='text/css' />
		    <item id='cover-image' href='images/book.jpeg' media-type='image/jpeg'/>
		    <item id='cap1' href='markupcap1.xhtml' media-type='application/xhtml+xml'/>
		    <item id='cap2' href='markupcap2.xhtml' media-type='application/xhtml+xml'/>
		    <item id='cap3' href='markupcap3.xhtml' media-type='application/xhtml+xml'/>
		  </manifest>
		  <spine toc='ncx'>
		    <itemref idref='cap1' />
		    <itemref idref='cap2' />
		    <itemref idref='cap3' />
		  </spine>
		</package>
	      

Come si può vedere, il content.opf si divide in tre parti (per il momento non considerare le prime due righe):

EPUB 3 ha modificato alcuni dettagli del file content.opf ma le componenti rimangono le stesse. Ne parleremo dopo aver introdotto l'xml. Per il momento basti considerare i file xml come dei documenti che contengono informazione strutturata. Cioè ogni elemento informativo contiene una etichetta che descrive il significato di quella informazione. Le etichette sono racchiusi dai segni minore '<' e maggiore '>' e il testo deve essere compreso tra una etichetta di apertura e la stessa etichetta di chiusura. Ad esempio:  <manifest>testo testo testo</manifest>.

Nell'EPUB 3 il testo deve essere scritto obbligatoriamente in HTML5 (con estensione xhtml) cioè il linguaggio di markup raccomandato dal W3C per il web. Nella versione precedente (EPUB 2) non c'è questo obbligo ed i documenti possono essere anche scritti in HTML (estensione html). La differenza consiste in una sintassi molto più rigorosa per l'HTML5. Ci occuperemo in una sezione apposita di xhtml. Per ora basti sapere che il markup xhtml è un vocabolario specializzato di xml in grado di essere interpretato dai browser per il web e dai lettori di epub. Ciascun tag descrive l'informazione contenuta nell'elemento. Solo per fare qualche esempio, il tag <h1> significa che il testo contenuto tra il tag di apertura ed il tag di chiusura deve essere interpretato come titolo di primo livello, il tag <h2> è un titolo di secondo livello, il tag <p> significa "paragrafo", etc.

Le specifiche contengono il suggerimento di spezzettare lunghi file html in file più piccoli. Ad esempio uno per ogni capitolo. Ma possono essere adottate soluzioni differenti.

Le immagini possono essere degli stessi formati del web: png, jpeg, svg e gif. Sebbene non obbligatorio, le immagini sono generalmente incluse in un folder denominato images e sono il target di link inseriti nei file html esattamente allo stesso modo in cui si creano i link nelle pagine web. È importante ricordare che le immagini non sono automaticamente ridimensionate, pertanto è importante prepararle con il formato, la risoluzione e le dimensioni che si vogliano ottenere nella resa finale.

Gli oggetto audio e video sono gestiti con le tecniche usuali dell'HTML5 (extensions e enhancements). Si tratta di tag speciali utilizzati per avviare l'ascolto di audio o la visione di video all'accadere di eventi, come il click.

Non abbiamo parlato sinora degli aspetti grafici dell'epub. Nel gergo del digital publishing si chiama presentazione, come ad esempio i font, i colori, i margini, i bordi, etc. Di questo si occupa il foglio di stile, o stylesheet (con estensione css). Il suo ruolo essenziale è di separare i contenuti dalla presentazione, esattamente come raccomandato dal W3C. Un foglio di stile è una lista di descrizioni di come ciascun elemento xhtml debba essere reso graficamente. Ad esempio, che font utilizzare per l'elemento h1? Quanto spesso deve essere il bordo di un box? Quale margine a sinistra deve essere utilizzato per le liste? E così via. A queste domande, il foglio di stile risponde. E i suoi ordini sono eseguiti dal lettore. Una buona ragione per cui è una buona idea separare i contenuti dalla presentazione consiste nella possibilità di modificare l'aspetto di un intero libro semplicemente modificando i valori del foglio di stile. Altrimenti sarebbe necessario intervenire manualmente per ogni elemento del testo. Nel passato, molte pagine web erano pasticciate in questo modo, e proprio per porre rimedio a questa incredibile complicazione il W3C raccomanda i fogli di stile. Per cui, per quanto sia tecnicamente possibile, è opportuno anche per l'epub evitare accuratamente di inserire elementi di stilizzazione nei tag xhtml, ricorrendo invece all'uso dei fogli di stile. 

Il documento di navigazione (chiamato anche TOC) è obbligatorio nell'ePub3.

TOC significa Table Of ContentTOC, in altri termini un sommario linkabile. Generalmente il TOC viene mostrato in un'area dedicata del lettore digitale, e consente di accedere direttamente con un link all'argomento cercato.

Il documento di navigazione è una delle più importanti novità dell'ePub3. Nelle specifiche precedenti (ePub2) il TOC era basato su un file toc.ncx (un file xml), ma nell'ePub3 diventa toc.xhtml, dunque un documento in xhtml, come i file di contenuto.

Il vantaggio è che può essere stilizzato allo stesso modo in cui possono essere stilizzati i contenuti con il CSS.

In questa fase di transizione è consigliabile inserire sia il vecchio tipo di TOC che il nuovo. Ciò consentirà al lettore digitale di mostrare il TOC anche se non ha aggiornato il suo software di lettura.

Più avanti ne parleremo in maggiore dettaglio.